Учебный военный центр при Томском государственном университете был учрежден на основании распоряжения Правительства Российской Федерации от 6 марта 2008 г. № 275-р «Об учебных военных центрах, факультетах военного обучения и военных кафедрах при федеральных государственных образовательных учреждениях..